课程名称: Plant Bioinformatics Capstone
课程主页: https://www.coursera.org/learn/plant-bioinformatics-capstone
所在平台: Coursera
课程类别: 生命科学
大学或机构: 多伦多大学
讲师: Nicholas James Provart
授课语言: 英语
提供字幕: 英语
课程文件大小: 7.64MB
课程介绍: 过去的15年是植物生物学中令人兴奋的一年。数百个植物基因组已经被测序,RNA-seq已经实现了转录组范围的表达谱,并且基于“seq”的方法的扩散已经允许以低成本和高通量的方式确定蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA的相互作用。这些数据集反过来允许我们通过点击鼠标或点击手指来产生假设。
在《Coursera.org的植物生物信息学》中,我们涵盖了33种植物特定的在线工具,从基因组浏览器到转录组数据挖掘到启动子/网络分析等,在《植物生物信息学顶点》中,我们将使用这些工具来假设一个未知功能基因的生物学作用,总结在一份书面的实验室报告中。
本课程是Coursera植物生物信息学专业的一部分,它介绍了核心生物信息学能力和资源,如NCBI基因库、Blast、多序列比对、生物信息学方法一中的系统发育学,其次是生物信息学方法二中的蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学和RNA-序列分析,此外还有植物生物信息学和植物生物信息学顶点课程中介绍的植物特异性概念和工具。
该课程/顶点是由多伦多大学文理学院开放课程倡议基金(OCIF)资助开发的,由埃迪·埃斯特万、威尔·海库普和尼古拉斯·普罗瓦特实施。Asher Pasha编程了一个基因ID随机化器。
本课程属于 Plant Bioinformatic Methods Specialization/专项课程 中的第4门课程。
课程压缩包下载地址(度盘链接 解压密码:xuebuyan.org):
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