课程名称(英文):Plant Bioinformatic Methods Specialization
课程名称(中文):Plant Bioinformatic Methods 专项课程
课程链接:https://www.coursera.org/specializations/plant-bioinformatic-methods
平台:Coursera
大学或机构:多伦多大学
课程介绍:过去的15年是植物生物学中令人兴奋的一年。数百个植物基因组已经被测序,RNA-seq已经实现了转录组范围的表达谱,并且基于“seq”的方法的扩散已经允许以低成本和高通量的方式确定蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA的相互作用。这些数据集反过来允许我们通过点击鼠标或点击手指来产生假设。
Coursera上的植物生物信息学专业介绍了核心生物信息学能力和资源,如NCBI的基因库、Blast、多序列比对、生物信息学方法一中的系统发育学,其次是生物信息学方法二中的蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学和RNA-序列分析。在植物生物信息学中,我们涵盖了33种植物特定的在线工具,从基因组浏览器到转录组数据挖掘到启动子/网络分析等。
最后,一个植物生物信息学顶点使用这些工具来假设一个未知功能的基因的生物学作用,总结在一份书面的实验室报告中。这种专业化对于任何现代植物分子生物学家来说都是有用的,他们希望对研究人员可以获得的令人难以置信的数据范围有所了解。《生物信息学方法二》中引入了少量的R编程,但大部分工具都是web应用。建议您使用笔记本电脑或台式电脑来运行这些程序,因为它们可能无法作为手机或平板电脑上的移动应用程序运行。
应用的学习项目
Coursera上的植物生物信息学专业介绍了核心生物信息学能力和资源,如NCBI的基因库、Blast、多序列比对、生物信息学方法一中的系统发育学,其次是生物信息学方法二中的蛋白质-蛋白质相互作用、结构生物信息学和RNA-序列分析。在植物生物信息学中,我们涵盖了33种植物特定的在线工具,从基因组浏览器到转录组数据挖掘到启动子/网络分析等。
最后,一个植物生物信息学顶点使用这些工具来假设一个未知功能的基因的生物学作用,总结在一份书面的实验室报告中。
包含课程详情(点击对应课程后方详情了解对应课程具体信息):
1、Bioinformatic Methods I/生物信息学方法 I(详情)
2、Bioinformatic Methods II/生物信息学方法 II(详情)
3、Plant Bioinformatics(详情)
4、Plant Bioinformatics Capstone(详情)
课程视频压缩包下载(度盘链接 解压密码:xuebuyan.org):
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