课程名称: whole genome sequencing of bacterial genomes tools and application

课程主页: https://www.coursera.org/learn/wgs-bacteria

所在平台: Coursera

课程类别: 生命科学

大学或机构: 丹麦技术大学

讲师： Lina Cavaco, Pimlapas Leekitcharoenphon

授课语言： 英语

提供字幕： 英语

课程文件大小： 1.71GB

课程介绍： 细菌基因组的全基因组测序-工具和应用：本课程将涵盖细菌基因组的全基因组测序（WGS）的主题，该主题与医学领域越来越相关。 WGS技术及其应用在国际政治议程上处于重要地位，因为经典方法已被WGS技术取代，因此生物信息学工具对于使该领域的人们能够分析数据并获得可解释的结果极为重要。并用于不同目的。本课程将为学习者提供一个基础，使他们了解并熟悉WGS在细菌监测中的应用，包括物种鉴定，抗菌素耐药性和毒力特性的分类和表征以及质粒的表征。它还将使学习者有机会学习在线工具，并通过演示如何使用其中一些工具和练习的方法来学习在线工具，并由学习者使用免费提供的WGS分析工具来解决。 在本课程结束时，您应该能够： 1.描述细菌分类的一般原则 2.举例说明全基因组测序在细菌病原体监测和抗药性监测中的应用 3.应用基因组工具进行分型和监测 4.定义下一代测序的概念，并描述来自NGS的测序数据 5.描述如何从原始读取到重叠群进行从头组装 6.列举用于物种识别，MLST分型和抗性基因检测的工具背后的方法 7.在其他细菌和病原体基因组的实际情况下，将工具用于物种识别，MLST分型和抗性基因检测。 8.描述沙门氏菌和大肠杆菌分型，质粒复制子检测和质粒分型工具背后的方法 9.在其他细菌和病原体基因组的实际案例中，使用沙门氏菌和大肠杆菌分型，质粒复制子检测和质粒分型的工具。 10.解释概念，并能够使用集成的细菌分析管道进行批处理分析和基因组数据分类 11.演示如何构建基于SNP的系统树 12.应用系统发育工具构建系统树，并说明细菌或病原体菌株的相关性 13.描述如何创建自己的序列数据库 14.利用MyDbFinder工具从全基因组测序中检测目标遗传标记

课程压缩包下载地址（度盘链接）：

友情提醒：