课程名称: Finding Mutations in DNA and Proteins(发现 DNA 和蛋白质的突变(生物信息学 VI))
课程主页: https://www.coursera.org/learn/dna-mutations
所在平台: Coursera
课程类别: 生命科学
大学或机构: 加州大学圣地亚哥分校
讲师: Pavel Pevzner, Phillip Compeau
授课语言: 英语
提供字幕: 英语
课程文件大小: 371MB
课程介绍: 在DNA和蛋白质中发现突变(生物信息学VI):在本专业的以前课程中,我们讨论了如何对基因组进行测序和比较。本课程将涵盖寻找DNA和蛋白质中潜伏的突变的高级主题。 在课程的前半部分,我们想问一个人的基因组与该物种的“参考基因组”有何不同。我们的目标是从个体中提取DNA的小片段,并将其“定位”到参考基因组。我们将看到解决这个问题的组合模式匹配算法既优雅又高效,只需要很少的运行时间和内存。 在本课程的后半部分,我们将学习如何识别蛋白质的功能,即使与具有已知功能但几乎无法识别的具有相似功能的相似蛋白质相比,它已经被如此多的突变轰炸了。例如,在HIV研究中就是这种情况,因为该病毒经常突变得如此之快,以至于研究人员很难对其进行研究。我们将使用的方法基于称为隐马尔可夫模型的强大机器学习工具。 最后,您将学习如何应用流行的生物信息学软件工具,这些工具应用隐马尔可夫模型将蛋白质与相关的蛋白质家族进行比较。
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