课程名称: Genome Sequencing（基因组测序（生物信息学 II））

课程主页: https://www.coursera.org/learn/genome-sequencing

所在平台: Coursera

课程类别: 生命科学

大学或机构: 加州大学圣地亚哥分校

讲师： Pavel Pevzner, Phillip Compeau

授课语言： 英语

提供字幕： 中英

课程文件大小： 268MB

课程介绍： 基因组测序（生物信息学II）：您可能听说过很多有关基因组测序及其在个性化医学时代的潜力，但是对基因组进行测序意味着什么？ 就像您从头到尾读一本书一样，生物学家仍然无法读取整个基因组的核苷酸。但是，他们可以读取DNA的短片段。在本课程中，我们将了解如何使用图论从这些短片段组装基因组。我们将进一步了解蛮力算法，并将其应用于测序称为抗生素的微型蛋白质。 在课程的前半部分，我们将看到生物学家无法阅读人类基因组的30亿个核苷酸，就像您从头到尾读一本书一样。但是，他们可以读取较短的DNA片段。在本课程中，我们将看到图论如何用于从这些短片段组装基因组，这相当于有史以来最大的拼图游戏。 在课程的下半部分，我们将讨论抗生素，因为MRSA等抗微生物耐药性细菌正在增加，因此与抗生素相关性很高。您知道抗生素是药物，但在分子水平上，它们是由细菌改造而成的可杀死敌人的短小蛋白。确定构成这些抗生素之一的氨基酸序列是一个重要的研究问题，这与通过组装微小的DNA片段进行基因组测序相似。我们将看到尝试所有可能解决方案的暴力算法如何能够识别天然存在的抗生素，以便可以在实验室中合成它们。 最后，您将学习如何使用流行的生物信息学软件工具来对已经获得抗生素抗性的致命葡萄球菌细菌的基因组进行测序。
课程大纲

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